从位图到布隆过滤器,C#实现

  • 从位图到布隆过滤器,C#实现已关闭评论
  • 174 次浏览
  • A+
所属分类:.NET技术
摘要

本文将以 C# 语言来实现一个简单的布隆过滤器,为简化说明,设计得很简单,仅供学习使用。


前言

本文将以 C# 语言来实现一个简单的布隆过滤器,为简化说明,设计得很简单,仅供学习使用。

感谢@时总百忙之中的指导。

布隆过滤器简介

布隆过滤器(Bloom filter)是一种特殊的 Hash Table,能够以较小的存储空间较快地判断出数据是否存在。常用于允许一定误判率的数据过滤及防止缓存击穿及等场景。

相较于 .NET 中的 HashSet 这样传统的 Hash Table,存在以下的优劣势。

优势:

  1. 占用的存储空间较小。不需要像 HashSet 一样存储 Key 的原始数据。

劣势:

  1. 存在误判率,过滤器认为不存在的数据一定不存在,但是认为存在的数据不一定真的存在。这个和布隆过滤器的实现方式有关。
  2. 不支持数据的删除,下文会讲为什么不支持删除。

数据的存储

布隆过滤器的数据保存在 位图(Bitmap)上。Bitmap 简而言之是二进制位(bit)的数组。Hash Table 保存每个元素的位置,我们称之为 桶(bucket), Bitmap 上的每一位就是布隆过滤器的 bucket。

布隆过滤器的每一个 bucket 只能存储 0 或 1。数据插入时,布隆过滤器会通过 Hash 函数计算出插入的 key 对应的 bucket,并将该 bucket 设置为 1。

查询时,再次根据 Hash 函数计算出 key 对应的 bucket,如果 bucket 的值是 1,则认为 key 存在。

Hash 冲突的解决方案

布隆过滤器使用了 Hash 函数,自然也逃不过 Hash 冲突的问题。对布隆过滤器而言,发生 Hash 冲突也就意味着会发生误判。

从位图到布隆过滤器,C#实现

传统 Hash 算法解决 Hash 冲突的方式有 开放定址法、链表法等。而布隆过滤器解决 Hash 冲突的方式比较特殊,它使用了多个 Hash 函数来解决冲突问题。

下图中插入布隆过滤器的 Bar 和 Baz 经过 Hash1 计算出的位置是同一个,但 Hash2 计算出的位置是不一样的,Bar 和 Baz 得以区分。

从位图到布隆过滤器,C#实现

即使布隆过滤器使用了这种方式来解决 Hash冲突,冲突的可能性依旧存在,如下图所示:

从位图到布隆过滤器,C#实现

由于布隆过滤器不保留插入的 Key 的原始值,Hash 冲突是无法避免的。我们只能通过增加 Hash 函数的数量来减少冲突的概率,也就是减少误判率。

假设布隆过滤器有 m 个 bucket,包含 k 个哈希函数,已经插入了 n 个 key。经数学推导可得误判率 ε 的公式如下:

从位图到布隆过滤器,C#实现

具体推断过程可参考 https://en.wikipedia.org/wiki/Bloom_filter。

布隆过滤器的误判概率大致和 已经插入的 key 的数量 n 成正比,和 hash函数数量 k、bucket 数 m 成反比。为了减少误判率,我们可以增加 m 或 增加 k,增加 m 意味着过滤器占用存储空间会增加,增加 k 则意味着插入和查询时的效率会降低。

为什么布隆过滤器不支持删除

布隆过滤器通过多个 Hash 函数来解决冲突的设计,也意味着多着插入元素可能会共享同样的 bucket,删掉一个元素的同时,也会被其他元素的一部分 bucket 给删掉。因此基于 Bitmap 实现的布隆过滤器是不支持删除的。

用 C# 实现 Bitmap

在实现布隆过滤器之前,我们首先要实现一个 Bitmap。

在 C# 中,我们并不能直接用 bit 作为最小的数据存储单元,但借助位运算的话,我们就可以基于其他数据类型来表示,比如 byte。下文用 byte 作为例子来描述 Bitmap 的实现,但不仅限于 byte,int、long 等等也是可以的。

位运算

下面是 C# 中位运算的简单介绍:

符号 描述 运算规则
& 两个位都为1时,结果才为1
| 两个位都为0时,结果才为0
^ 异或 两个位相同为0,相异为1
~ 取反 0变1,1变0
<< 左移 各二进位全部左移若干位,低位补0
>> 右移 各二进位全部右移若干位,高位补0

一般来说,我们要进行位运算计算的数据通常都是由多个二进位组成的。对两个数字使用 &|^ 这三个运算符时,需要对齐两个数字的右边,一位位地进行计算。

// 0b 代表值用二进制表示数字 short a =                     0b0111111111111001; byte  b =                            0b011111111; short c = (short)(a & b);  // 0b0111111111111001 short d = (short)(a | b);  // 0b0111111111111111 short e = (short)(a ^ b);  // 0b0000000000000110 byte  f = (byte)~b;                  0b011111111; short g = (short)(b << 1); // 0b0000000111111111; short h = (short)(b >> 1); // 0b0000000001111111; 

利用位运算创建 Bitmap

借助 byte 实现 Bitmap,也就是要能够修改和查看 byte 上的每一个 bit 的值,同时,修改要能够实现幂等。

  1. 指定位设置成 1
    按前面说的位运算的规则,是不能够单独修改 bit 序列中某一位的。位运算需要从右到左一对对计算。
    使用 | 可以实现这个功能。假设我们要改变从右开始下标为 3(初始位置0) 的 bit 的值,则需要准备一个该位置为 1,其他位置都是 0 的 bit 序列,与要改变的 bit 序列进行 | 运算。
// 为了将 a 的右边数起第 3 位改成 1,需要准备一个 b byte a =            0b010100010; byte b = 1 << 3; // 0b000001000 a |= b;          // 0b010101010 
  1. 指定位设置成 0
    和设置成 1 正好相反,需要准备一个指定位置为 0,其他位置都是 1 的 bit 序列,与要改变的 bit 序列进行 & 运算。
byte a =            0b010101010; byte b = 1 << 3; // 0b000001000 b = ~b;          // 0b111110111 a &= b;          // 0b010100010 
  1. 查看指定位的值
    利用 & 运算符,只要计算结果不为 0,就代表指定位置的值为 1。
byte a =            0b010101010; byte b = 1 << 3; // 0b000001000; a &= b;          // 0b000001000; 

了解了基本的操作之后,我们把数据存储到 byte 数组上。

从位图到布隆过滤器,C#实现

class Bitmap {     private readonly byte[] _bytes;     private readonly long _capacity;      public Bitmap(long capacity)     {         _capacity = capacity;         _bytes = new byte[_capacity / 8 + 1];     }      public long Capacity => _capacity;      public void Set(long index)     {         if (index >= _capacity)         {             throw new IndexOutOfRangeException();         }          // 计算出数据存在第几个 byte 上         long byteIndex = index / 8;         // 计算出数据存在第几个 bit 上         int bitIndex = (int)(index % 8);         _bytes[byteIndex] |= (byte)(1 << bitIndex);     }      public void Remove(long index)     {         if (index >= _capacity)         {             throw new IndexOutOfRangeException();         }          long byteIndex = index / 8;         int bitIndex = (int)(index % 8);         _bytes[byteIndex] &= (byte)~(1 << bitIndex);     }      public bool Get(long index)     {         if (index >= _capacity)         {             throw new IndexOutOfRangeException();         }          long byteIndex = index / 8;         int bitIndex = (int)(index % 8);          return (_bytes[byteIndex] & (byte)(1 << bitIndex)) != 0;     } } 

用 C# 实现 布隆过滤器

有了 Bitmap,我们再把 Hash 函数的实现准备好,一个简单的布隆过滤器就可以完成了。这里,我们参考 guava 这个 java 库的实现。

https://github.com/google/guava/blob/master/guava/src/com/google/common/hash/BloomFilter.java

MurmurHash3 的使用

我们使用和 guava 一样的 MurmurHash3 作为 Hash 函数的实现。

下面是笔者在 github 上找到的一个可用实现。

https://github.com/darrenkopp/murmurhash-net

使用这个库,我们可以将任意长的 byte 数组转换成 128 位的二进制位,也就是 16 byte。

byte[] data = Guid.NewGuid().ToByteArray();  // returns a 128-bit algorithm using "unsafe" code with default seed HashAlgorithm murmur128 = MurmurHash.Create128(managed: false); byte[] hash = murmur128.ComputeHash(data); 

将任意类型的 key 转换为 byte 数组

Funnel 与 Sink 的定义

我们需要将各种类型 key 转换成 MurmurHash 能够直接处理的 byte 数组。为此我们参考 guava 引入下面两个概念:

  1. Funnel:将各类数据转换成 byte 数组,包括 int、bool、string 等built-in 类型及自定义的复杂类型。

  2. Sink:Funnel 的核心组件,作为数据的缓冲区。Funnel 在将自定义的复杂类型实例转换成 byte 数组时,就需要将数据拆解分批写入 sink。

Funnel 可以定义成如下的委托,接受原始值,并将其写入 sink 中。

delegate void Funnel<in T>(T from, ISink sink); 

Sink 将不同类型的数据转换成 byte 数组并汇总到一起。

interface ISink {     ISink PutByte(byte b);          ISink PutBytes(byte[] bytes);      ISink PutBool(bool b);          ISink PutShort(short s);      ISink PutInt(int i);      ISink PutString(string s, Encoding encoding);      ISink PutObject<T>(T obj, Funnel<T> funnel);      /// ... 其他 built-in 类型,读者可自行补充 } 

简单的 Funnel 实现如下所示:

public class Funnels {     public static Funnel<string> StringFunnel = (from, sink) =>         sink.PutString(from, Encoding.UTF8);          public static Funnel<int> IntFunnel = (from, sink) =>         sink.PutInt(from); } 

自定义复杂类型的 Funnel 实现则可以数据拆解分批写入 sink。复杂类型的实例成员依旧可能是复杂类型,因此我们要在 Sink 上实现一个 PutObject 来提供套娃式拆解。

Funnel<Foo> funnelFoo = (foo, sink) => {     sink.PutString(foo.A, Encoding.UTF8);     sink.PutInt(foo.B);          Funnel<Bar> funnelBar = (bar, barSink) => barSink.PutBool(bar.C);     sink.PutObject(foo.Bar, funnelBar); };  class Foo {     public string A { get; set; }      public int B { get; set; }      public Bar Bar { get; set; } }  class Bar {     public bool C { get; set; } } 

Sink 的实现

Sink 的核心是 byte 数组缓冲区的实现,利用 ArrayPool 我们可以很方便的实现一个 ByteBuffer。

class ByteBuffer : IDisposable {     private readonly int _capacity;     private readonly byte[] _buffer;     private int _offset;     private bool _disposed;      public ByteBuffer(int capacity)     {         _capacity = capacity;         _buffer = ArrayPool<byte>.Shared.Rent(capacity);     }      public void Put(byte b)     {         CheckInsertable();         _buffer[_offset] = b;         _offset++;     }      public void Put(byte[] bytes)     {         CheckInsertable();         bytes.CopyTo(_buffer.AsSpan(_offset, bytes.Length));         _offset += bytes.Length;     }      public void PutInt(int i)     {         CheckInsertable();         BinaryPrimitives.WriteInt32BigEndian(GetRemainingAsSpan(), i);         _offset += sizeof(int);     }          public void PutShort(short s)     {         CheckInsertable();         BinaryPrimitives.WriteInt32BigEndian(GetRemainingAsSpan(), s);         _offset += sizeof(short);     }      // ... 其他的 primitive type 的实现      public Span<byte> GetBuffer() =>         _buffer.AsSpan(.._offset);      public bool HasRemaining() => _offset < _capacity;      public void Dispose()     {         _disposed = true;         ArrayPool<byte>.Shared.Return(_buffer);     }      private void CheckInsertable()     {         if (_disposed)         {             throw new ObjectDisposedException(typeof(ByteBuffer).FullName);         }          if (_offset >= _capacity)         {             throw new OverflowException("Byte buffer overflow");         }     }      private Span<byte> GetRemainingAsSpan() => _buffer.AsSpan(_offset..); } 

Sink 则是对 ByteBuffer 的进一步封装,来适配当前使用场景。

class Sink : ISink, IDisposable {     private readonly ByteBuffer _byteBuffer;      /// <summary>     /// 创建一个新的 <see cref="Sink"/> 实例     /// </summary>     /// <param name="expectedInputSize">预计输入的单个元素的最大大小</param>     public Sink(int expectedInputSize)     {         _byteBuffer = new ByteBuffer(expectedInputSize);     }      public ISink PutByte(byte b)     {         _byteBuffer.Put(b);         return this;     }      public ISink PutBytes(byte[] bytes)     {         _byteBuffer.Put(bytes);         return this;     }      public ISink PutBool(bool b)     {         _byteBuffer.Put((byte)(b ? 1 : 0));         return this;     }      public ISink PutShort(short s)     {         _byteBuffer.PutShort(s);         return this;     }      public ISink PutInt(int i)     {         _byteBuffer.PutInt(i);         return this;     }      public ISink PutString(string s, Encoding encoding)     {         _byteBuffer.Put(encoding.GetBytes(s));         return this;     }      public ISink PutObject<T>(T obj, Funnel<T> funnel)     {         funnel(obj, this);         return this;     }      public byte[] GetBytes() => _byteBuffer.GetBuffer().ToArray();      public void Dispose()     {         _byteBuffer.Dispose();     } } 

k 个 Hash 函数与 布隆过滤器 实现

上文提到了 布隆过滤器 通过 k 个 hash 函数来解决 hash 冲突问题。实践中,我们可以把一次 murmur hash 的计算结果(16 byte)拆分为两部分并转换为 long 类型(一个 long 是 8 byte)。

这两部分结果分别保存到 hash1 和 hash2,第 k 个 hash 函数是对 hash1 和 hash2 的重新组合。

hash(k) = hash1 + (k-1) * hash2

public class BloomFilter<T> {     private readonly int _hashFunctions;     private readonly Funnel<T> _funnel;     private readonly int _expectedInputSize;     private readonly Bitmap _bitmap;     private readonly HashAlgorithm _murmur128;      /// <summary>     /// 创建一个新的 <see cref="BloomFilter"/> 实例     /// </summary>     /// <param name="funnel">与插入元素类型相关的<see cref="Funnel"/>的实现</param>     /// <param name="buckets">BloomFilter 内部 Bitmap 的 bucket 数量,越大,误判率越低</param>     /// <param name="hashFunctions">hash 函数的数量,越多,误判率越低</param>     /// <param name="expectedInputSize">预计插入的单个元素的最大大小</param>     public BloomFilter(Funnel<T> funnel, int buckets, int hashFunctions = 2, int expectedInputSize = 128)     {         _hashFunctions = hashFunctions;         _funnel = funnel;         _expectedInputSize = expectedInputSize;          _bitmap = new Bitmap(buckets);         _murmur128 = MurmurHash.Create128(managed: false);     }      public void Add(T item)     {         long bitSize = _bitmap.Capacity;          var (hash1, hash2) = Hash(item);          long combinedHash = hash1;         for (int i = 0; i < _hashFunctions; i++)         {             _bitmap.Set((combinedHash & long.MaxValue) % bitSize);             combinedHash += hash2;         }     }       public bool MightContains(T item)     {         long bitSize = _bitmap.Capacity;          var (hash1, hash2) = Hash(item);          long combinedHash = hash1;         for (int i = 0; i < _hashFunctions; i++)         {             if (!_bitmap.Get((combinedHash & long.MaxValue) % bitSize))             {                 return false;             }              combinedHash += hash2;         }          return true;     }       [MethodImpl(MethodImplOptions.AggressiveInlining)]     private (long Hash1, long Hash2) Hash(T item)     {         byte[] inputBytes;         using (var sink = new Sink(_expectedInputSize))         {             sink.PutObject(item, _funnel);             inputBytes = sink.GetBytes();         }          var hashSpan = _murmur128.ComputeHash(inputBytes).AsSpan();          long lowerEight = BinaryPrimitives.ReadInt64LittleEndian(hashSpan.Slice(0,8));         long upperEight = BinaryPrimitives.ReadInt64LittleEndian(hashSpan.Slice(8,8));         return (lowerEight, upperEight);     } } 

扩展

带计数器的布隆过滤器

上文讲到基于 Bitmap 实现的布隆过滤器不支持删除,但如果把 Bitmap 这个 bit 数组换成 n 个 bit 作为一个bucket的数组,那单个 bucket 就具备了计数能力。这样删掉一个元素的时候,就是在这个计数器上减一,借此能够在有限的范围内实现带删除功能的布隆过滤器,代价是,存储空间会变成原来的 n 倍。
从位图到布隆过滤器,C#实现

分布式布隆过滤器实现方案

如果你有布隆过滤器的实际使用需求,并且是在分布式环境,笔者推荐下面这个库,它是作为 redis 的插件提供的,详情点击下方链接。
https://github.com/RedisBloom/RedisBloom

代码地址

为方便学习,本文所有的代码均已整理在 github:https://github.com/eventhorizon-cli/EventHorizon.BloomFilter